La mise en œuvre de MATS comprend les éléments suivants : 

1. Analyse multi-méthodes : un ensemble de 15 études de cas approfondies portant sur des pays, des régions et des produits, afin de mieux comprendre les conditions d'un commerce durable, une simulation multi-modèle intégrée et une évaluation des liens avec les dynamiques des marchés agricoles, du commerce et des investissements, ainsi qu'une analyse des cadres institutionnels, réglementaires et juridiques ; 

2. Explorer les voies vers le commerce durable : une approche de prévision et de rétro-prévision multipartite liée au changement transformateur et à l'innovation sociale, qui utilise de nouvelles méthodes et plateformes participatives pour explorer les voies de transition vers le commerce durable ; 

3. Consultation et dialogue politique : regroupement avec d'autres projets de recherche liés au commerce et promotion du dialogue avec les représentants du secteur, les mouvements sociaux et les décideurs politiques pour encadrer les analyses, co-évaluer les liens et formuler des recommandations politiques.